部分建筑企业由于对税收政策不熟悉，未区分会计和税法的收入确认原则差异，导致企业在取得建筑劳务收入时未及时确认收入，容易产生税款滞纳风险。
建筑企业工程周期长、通常会大量雇佣合同工和临时工，对一些零散的人工费用、分包费用，部分情况下未能及时取得合法有效的税前扣除凭证，但同时又将相应的支出违规进行税前扣除，容易产生涉税风险。
建筑企业在施工工程承租了施工设备如脚手架、钩机等，若出租方配备了操作人员，应取得税率为9%的增值税发票，如对策把握不准，企业可能以购进有形动产租赁服务取得税率为13%的增值税发票，产生涉税风险。
根据《财政部 国家税务总局关于印花税若干政策的通知》(财税〔2006〕162号)第一条，对纳税人以电子形式签订的各类应税凭证按规定征收印花税。
建筑企业一般规模较大，业务链复杂，签订建筑施工、工程采购、劳务分包等合同较多，加上纸质版合同管理难、效率低，越来越多建筑企业采用电子化的合同，容易忽略电子合同的印花税申报。
建筑企业中的增值税一般纳税人可以就不同的项目，分别依法选择适用一般计税方法或简易计税方法。在企业实际经营过程中，购进的货物、劳务和服务一般用于多个项目，可能存在购进货物、劳务和服务用于简易计税项目取得增值税专用发票并抵扣了增值税进项税额的问题，存在较大的税收风险。
建筑业的增值税纳税义务时间按照开票时间、收款时间和书面合同约定的付款时间孰先的原则确认。有部分建筑企业对政策理解不深，认为不收款就不确认增值税收入，由于业主资金困难未按照合同约定的时间支付工程款等原因，未按合同约定的付款日期确认纳税义务发生的时间，存在较大税收风险。
建筑工程总承包单位为房屋建筑的地基与基础、主体结构提供工程服务，建设单位自行采购全部或部分钢材、混凝土、砌体材料、预制构件的，适用简易计税方法计税。
部分建筑企业对税收政策把握不准，容易错误选择计税方法，应适用简易计税的未适用简易计税。此外，根据《国家税务总局关于国内旅客运输服务进项税抵扣等增值税征管问题的公告》(国家税务总局公告2019年第31号)规定，自2019年10月1日起，提供建筑服务的一般纳税人按规定适用或选择适用简易计税方法计税的，不再实行备案制，相关证明材料无需向税务机关报送，改为自行留存备查。部分纳税人选择适用简易计税方法的建筑服务，容易忽略留存相关证明材料。
(二)为甲供工程提供的建筑服务、以清包工方式提供的建筑服务，留存建筑工程承包合同。