由于我国增值税多档税率共存，企业之间适用的税率存在一定的差异，在增值税留抵退税会计处理过程中，可能会出现税务倒挂的现象。所以，为了能够进行高效的增值税留抵退税会计处理，必须先对其增量留抵税额概念进行明确，根据留抵退税要求进行会计处理。
在企业进行增值税留抵退税处理前，增值税一般纳税人以及专业处理机关可以对国家税务总局下发的有关通知文件进行了解，正确认识增量留抵税额概念，按照国家税务总局相关通知文件要求进行会计处理和增值税留抵退税操作，降低在增值税留抵退税会计处理过程中出现税务风险问题和处理申请失败问题的概率，保证增值税留抵退税工作的有序推进。
（二）注意留抵税额退税申请人条件
增值税留抵退税对申请人的信用评价、违法违规情况有一定要求，所以，在处理增值税留抵退税申请时，一定要注意对申请人的条件进行分析，确保申请人条件符合要求。
从国家税务总局下发的文件来看，对增值税一般纳税人留抵税额退税条件有着严格的要求和规定，只有纳税人信用等级在C级以上才允许进行留抵税额退税申请，并且增值税一般纳税人还要保证自己在申请留抵税额退税36个月内未出现违法违规的税务操作，其留抵税额退税申请才会通过，享受增值税留抵退税政策。
如果增值税一般纳税人的纳税信用等级以及纳税行为在申请留抵退税时，满足申请要求，但是后续出现纳税信用等级下降无法满足申请条件时，对于已退税款，税务机关做不追回处理。
另外，由于我国多种税务政策共存形式，同一种税务情况可以有不同的税务处理方案。因此，在纳税人申请增值税留抵退税时，一定要注意纳税人是否还享受了其他税务优惠政策，妥善处理增值税留抵退税申请。
（三）对增量留抵税额退还进行计算
在增值税留抵退税时，科学计算税额才能避免税务风险，保证减税降费政策推行目的的落实。增量留抵退还税额的计算通过增量留抵税额、进项构成比例、增值税一般纳税人所能享受的退税率三项数据相乘即可得到。
从国家相关税务政策研究来看，增值税一般纳税人可以享受的退税率为百分之六十，作为先进制造业的纳税人则可以享受百分之百的退税率。因此，在进行增值税留抵退税额计算时，要注意对纳税人所属行业进行分析，分辨纳税人属于一般纳税人还是先进制造业纳税人，确定其能享受的退税率，再结合实际情况和相关政策科学计算纳税人应退税的额度。
（四）其他增值税留抵退税注意事项
除了以上常见的增值税留抵退税处理注意事项之外，在增值税留抵退税会计处理过程中还会出现各类不同情况，稍不注意就会对会计处理结果造成影响，产生税务风险。因此，在对增值税留抵退税进行处理时，一定要结合相关政策文件，注意增值税留抵退税处理要求才能科学处理增值税留抵退税申请。
（一）一般纳税人期末留抵税额的会计处理和分析
一般纳税人增值税留抵退税主要碰到的会计处理情况分为期末留抵税额处理、经营地点迁移留抵税额处理、资产重组留抵税额处理、清算时期留抵税额处理以及应补缴税款留抵税额处理等五大常见处理情况。
在增值税一般纳税人期末留抵税额会计处理过程中，《增值税暂行条例》表明，所应该缴纳的税额以一般纳税人当期的销项税额减去进项税额后得到。如果在一般纳税人应该缴纳税额计算过程中，当期销项税额不足以进行抵扣的话，其剩余税额则可以进行结转，在下期处理过程中进行抵扣。
例如某一般纳税公司，其纳税人在2021年6月1号之前的未交增值税账户贷方余额为12万，6月份发生购进业务价款为400万元，其中增值税为68万元，销售产品价款为200万元，当期销项税额为34万元。
在进行增值税留抵退税处理时，由于6月份后产生的留抵税额不可以抵减之前的欠缴税额，所以，当期销项税额34万元即为月末增值税留抵税额，不需要再转入到未交增值税中进行处理，直接可以留到下月进行抵扣。
（二）一般纳税人经营地点迁移留抵税额会计处理
在一般纳税人增值税留抵退税处理过程中，还会遇见纳税人经营地点变动问题。由国家税务局相关公告得知，当一般纳税人经营地点出现变动时，在工商部门做好变更登记后，如果主管税务机关有变动，需要做好经营地点注销和再登记工作。同时，一般纳税人在税务注销之前还未进行抵扣的进项税额，重新登记办理后可以继续进行抵扣。
例如某公司之前经营地点在A市B区，因公司业务发展原因搬迁至A市C区进行生产，在搬迁之前，公司还未进行抵扣的进项税额有15万，当公司办理完税务注销和重新注册后，新搬迁的C区税务主管机关对尚未抵扣的进项税额进行确认且无误后，公司可以继续使用这15万尚未抵扣的进项税额进行抵扣。
（三）一般纳税人资产重组留抵税额会计处理分析
国家税务总局相关公告规定，在一般纳税人进行资产重组，将所有资产和负债全部转让给新的一般纳税人，并按照公告规定进行税务注销重新登记办理后，在资产重组前未抵扣的进项税额依旧可以结转给新的一般纳税人进行抵扣。
例如A公司和B公司同为一般纳税人，当A公司进行资产重组把所有资产和负债转让给B公司时，A公司还留20万增值税留抵税额未抵扣，在进行税务注销办理时，A公司不需要再对这部分税额重新转让处理，B公司只要按照原先的流程进行20万的留抵税额申报抵扣即可。
（四）一般纳税人清算时期留抵税额会计处理分析
在企业经营纳税过程中，因为经营不善或者其他因素影响导致公司破产进行清算情况下，对于增值税留抵退税会计处理考虑以《增值税若干政策的通知》为依据进行。在相关政策通知中明确表明，增值税一般纳税人进行公司资产清算注销时，其留抵税额不做退税处理，且公司存货也不能作为进项税额进行转出操作。
所以，在一般纳税人清算时期，对于增值税留抵税额的处理，只能将其转为存货成本进行计算。同时，在公司计算应纳税所得额时，公司增值税留抵税额可以做扣除处理。按照国家税务局相关公告通知才能有效处理增值税留抵退税问题，做好增值税留抵退税会计处理工作，避免在处理操作过程中出现税务问题。
（五）一般纳税人应补缴税款的留抵税额会计处理
在增值税一般纳税人纳税过程中，还会出现增值税欠税情况，当增值税留抵退税会计处理遇到这一情况时，则可以以国家税务局相关通知为依据进行一般纳税人应补缴税款额留抵税额会计处理操作，避免会计处理过程中税务问题的发生。
在国家税务局颁发的一般纳税人应补缴税款留抵税额会计处理相关文件中，对进项税额抵扣增值税欠税的次序、范围都有明确的规定。在进项税额抵扣增值税欠税时，主要按照公司欠税发生的时间次序进行税额抵扣，即先发生的欠税先抵扣，后发生的欠税后抵扣。可以抵扣的增值税欠税主要为呆账欠税和欠税滞纳金，实际抵扣金额则以主管税务机关所开具的通知书为主。
如果在一般纳税人应补缴税款的留抵税额会计处理过程中出现期末留抵税额小于应补缴税款总额的情况，则以期末留抵税额作为实际抵扣的税额。同时，按照相应的计算方式对期末留抵税额能够抵扣的呆账欠税以及欠税滞纳金进行计算，合理进行应补缴税款的留抵税额会计处理工作，规避增值税留抵退税过程中风险问题发生的概率，保证会计处理质量和效率。
（一）增量留抵税额计算错误风险和防范
在增值税留抵退税过程中，增量留抵税额计算错误是常见的处理风险问题，会对增值税留抵退税申请以及处理结果造成直接的影响。所以，在进行增量留抵税额计算时，应当特别关注计算结果的准确性，避免因为计算结果错误导致增量留抵退税申请失败。
增量留抵税额的计算可以结合纳税人申请条件进行考虑，会计人员要对增量留抵税额的滚动计算方式有一个明确的了解。
从国家税务总局颁发的相关文件来看，增值税一般纳税人可以享受百分之六十的退税率，个别先进制造企业则可以享受百分之百的退税率。
因此，企业在进行增量留抵税额计算时，也要结合自身行业政策进行计算分析，确保增量留抵税额计算结果的准确性，控制增量留抵税额会计处理风险问题发生。
如若企业在增值税留抵退税计算过程中存在问题，也可以及时向主管税务机关或者是专业的税务处理服务机构进行请示咨询，提前防范控制增量留抵税额会计处理风险问题的发生。
（二）纳税人规定标准未达到风险和防范
在增值税留抵退税过程中，还会因为纳税人规定标准评定不达标而出现增值税留抵退税风险，影响增值税留抵退税工作的实施。所以，在进行增值税留抵退税工作时，应当对纳税人的信用评级、违法违规情况、已享受相关税收优惠情况等进行了解分析，评定纳税人是否达到增值税留抵退税的申请标准。
同时，纳税人自身也要加强对纳税信用提升的重视，维护自身纳税信用，避免在纳税过程中因为违法偷税漏税情况的发生而导致无法满足增值税留抵退税标准。
如果纳税人的情况可以适应多项税收政策，最终的税收方式还是要以最优方案为主。并且在选择对应的税收政策后，还要注意其他税收政策和增值税留抵退税政策的不相容，避免在纳税会计处理过程中出现税务风险问题。
另外，由于新设的企业纳税信用等级为M级，是不满足增值税留抵退税要求的，所以，在评定纳税人标准时要特别注意。
（三）时间方面规定内容忽视风险和防范
在增值税留抵退税会计处理过程中，还容易因为时间方面规定的不注意出现处理风险。国家税务局下发的相关文件中明确提出，如果增值税一般纳税人已经办理过增量留抵退税申请，之后再产生留抵税额时，前期申请计算过的留抵税额就不可以再进行二次利用了。
所以，总结来说，增值税留抵退税一个年度内最多只有两次处理机会。增值税一般纳税人在满足增值税留抵退税要求后的任意一个次月就可以进行增量留抵退税申请，具体申请时间以纳税人自身情况为主。
另外，如果纳税人在同一时间一同进行免抵退税和留抵退税申报的话，税务机关会优先对其申请的免抵退税要求进行办理。所以，纳税人在退税业务办理过程中，为了避免出现这类风险，要对不同退税业务进行大致了解，注意各退税业务的申请时间。
（四）申请材料未及时准确获得风险防范
由增值税留抵税额计算公式分析可以发现，除了规定的申请材料以及凭证之外，其他抵扣凭证上的进项税额不可以作为增值税留抵退税申请凭证。
所以，为了避免因为申请材料收集不全面而出现增值税留抵退税风险问题，必须在增值税产生过程中就进行相关凭证收集，及时收集整理申报材料，并保证所提交申请材料和凭证真实可靠，符合国家税务总局相关申报条例要求，不得进行申请材料和凭证伪造，一旦发现申请人通过不法手段进行申请材料造假，对增量留抵税额进行骗取，其将要承担相应的法律责任。通过增值税留抵退税申请材料可靠性和真实性的提升，开展高质量的会计处理工作。